Sama skrzynia nie ma wpływu. Na skrzyni jest zamontowany impulsator (w nowej też będzie). Sprawdź tylko wtykę po lewej stronie skrzyni i przewody do niej idące jak będziesz zmieniać skrzynię.
Napisałeś, że przewód minusowy masz przypalony. Teraz moje pytanie skąd chcesz mieć w nim napięcie? Podłącz miernik do masy "gdziekowiek" i sprawdź napięcie w kostce. Przewody masz rozrysowane w albumie schematów elektrycznych "Sam Naprawiam" strona 360